Согласно новому исследованию, опубликованному в Американском журнале генетики человека, более трети генетических вариантов, повышающих риск ишемической болезни сердца, регулируют экспрессию генов в печени. Эти варианты влияют, среди прочего, на экспрессию генов, регулирующих метаболизм холестерина. Полученные данные позволяют по-новому взглянуть на генетику ишемической болезни сердца. Исследование проводилось в сотрудничестве между Университетом Восточной Финляндии, Университетской больницей Куопио, Калифорнийским университетом в Лос-Анджелесе и Университетом Аризоны.
Ишемическая болезнь сердца (ИБС) и ее наиболее серьезное осложнение – инфаркт миокарда (ИМ) – одни из основных причин смерти в западном мире. Как генетические факторы, так и факторы окружающей среды способствуют развитию заболевания, и недавние полногеномные исследования ассоциации выявили около 200 локусов риска для ИБС. Однако подавляющее большинство таких вариантов расположены в некодирующих областях генома и не имеют известной биологической функции. Несмотря на то, что функциональная характеристика таких вариантов в прошлом была сложной, благодаря новым и передовым методам геномики, таким как RNA-seq, ChIP-seq, STARR-seq и HiC, а также вычислительному анализу, понимание функций вариантов теперь возможно.
Участие печени в прогрессировании ишемической болезни сердца до конца не изучено. В новом исследовании исследователи показывают, что более одной трети вариантов риска ИБС расположены в регуляторных элементах, специфичных для печени, и они действуют, чтобы регулировать экспрессию генов, участвующих в традиционных факторах риска, таких как признаки, связанные с глюкозой и холестерином.
"Наши результаты не только подтверждают корреляцию между уровнем холестерина и риском ишемической болезни сердца, но также впервые определяют причинный однонуклеотидный полиморфизм и потенциальные гены-мишени, которые опосредуют риск," говорит доцент Минна Кайкконен-Мяття из Университета Восточной Финляндии.
Другим важным открытием стало открытие того, что регуляторные элементы, содержащие варианты риска, часто, по-видимому, регулируют многие гены, а не только один.
"В целом, наши результаты расширяют список генов и регуляторных механизмов, действующих в печени и регулирующих риск развития ИБС. Расшифровка сетей регуляции генов становится все более важной для понимания механизмов заболевания и разработки лекарственных препаратов следующего поколения," Доцент Кайкконен-Мяэття говорит:.