Изучение, сообщил в издании Nature Chemical Biology, кроме этого продемонстрировал, что один из сравнительно не так давно произведенных комплексов вмешивается в закрепление белка ВИЧ к людской белку, сотрудничество, крайне важное для жизненного цикла вируса.Большая часть упрочнений изобретения лекарства сосредотачивается на вызывающих заболевание сотрудничествах в белках и ферментах, каковые включают хорошие механизмы «ключа-и-замка», сообщили учитель химии Университета Иллинойса Уилфред ван дер Донк, Говард Хьюз Медицинский Следователь Университета кто co-led изучение с Саутгемптонским университетом химический учитель биологии Али Тэвэссоли. «Как правило мелкие химические наркотики связывают с впадинами в ферментах, где химические реакции происходят. Связывая с этими щелями, наркотики мешают тому, дабы ферменты трудились».Но большое количество процессов заболевания включают сотрудничества белка белка, каковые не соответствуют данной модели, сообщил ван дер Донк.
«Их продолжительно вычисляли сложными, по причине того, что они не включают такие впадины. Эти сотрудничества белка белка довольно часто составляются из расширенных поверхностей, каковые возможно тяжело запретить с мелкими молекулами», сообщил он.Линейные пептиды кроме этого проблематичны. Они смогут быть «эластичным диском, как спагетти, и исходя из этого солидную часть времени находятся в неправильных ориентациях, дабы связать», сообщил ван дер Донк.
Циклические молекулы, складывавшиеся из одного либо нескольких колец аминокислот, более стабильны и менее чувствительны к клеточным ферментам, каковые имеют тенденцию жевать от финишей линейных пептидов. Они, так более возможно, удачно свяжут с их целями.
В новом изучении ван дер Донк и его сотрудники применяли фермент, что они нашли от бактерии, которая живет в океане.«Естественная роль этого фермента обязана сделать примерно 30 разных циклических белков, и мы удостоверились в надежности, имела возможность ли бы она сделать аналоги этих натуральных продуктов в кишечной палочке», сообщил ван дер Донк.
E. coli употреблялся в качестве создающей препарат фабрики для фармацевтических продуктов.Генетические последовательности, засунутые в E. coli все закодированные для серии аминокислот, признаны ферментом.
Непоследовательно додавая определенные аминокислоты к данной «последовательности фаворита», команда смогла произвести библиотеку больше чем миллиона неповторимых мультициклических белков.Tavassoli и его коллеги после этого удостоверились в надежности эту библиотеку в генетически спроектированном E. coli для белков, каковые имели возможность прервать закрепление белка ВИЧ к его людской цели клетки – хозяина.«Мы спроектировали гены E. coli, напрягаются так, что его выживание зависело от разрушения сотрудничества между белком и человеческим белком ВИЧ», сообщил Тэвэссоли. Его команда отыскала трех потенциальных терапевтических агентов.
Потом тестирование продемонстрировало, что один из трех трудился оптимальнее . В пробирке и в клетках, комплекс, который связан с людской белком, мешая белку ВИЧ взаимодействовать с ним.Данный агент отдела по борьбе с наркотиками, возможно, не будет употребляться терапевтически, но, потому, что у этого смогут быть токсичные побочные эффекты в громадных дозах в следствии его сотрудничества с людской белком, сообщили исследователи.
«Настоящий прогресс вот – свойство произвести библиотеки миллионов возможно терапевтических агентов», сообщил Тэвэссоли. «Они могли быть продемонстрированы, дабы выяснить ингибиторы вторых связанных с заболеванием процессов, что есть, где его настоящий потенциал находится».