Исследователи из Университета Хельсинки, Финляндия, и Каролинского института, Швеция, обнаружили ранее не охарактеризованные мутационные паттерны в регуляторном геноме человека, особенно при раке желудочно-кишечного тракта.
Исследование, опубликованное в Nature Genetics под руководством профессора Академии Лаури Аалтонена из Хельсинкского университета и профессора Юсси Тайпале из Каролинского института, было основано на изучении более двухсот полных геномов образцов колоректального рака. Ученые обнаружили отчетливое скопление мутаций именно в тех местах, где белки CTCF и когезин связывают ДНК.
И CTCF, и когезин являются факторами транскрипции, выполняющими важные функции в геноме, включая регуляцию экспрессии генов и структуры хроматина. В гипермутированных опухолях сайты CTCF / когезин, по-видимому, защищены от мутаций, в то время как в отдельном наборе опухолей сайты CTCF / когезин мутируются с большей частотой, чем ранее известные белки, кодирующие гены рака. Опухоли с высокой нагрузкой мутаций сайта CTCF, как правило, имеют более высокую частоту определенных типов мутаций, распределенных по всему их геному. Процесс, вызывающий эти мутации, до конца не изучен и требует дальнейшего изучения.
До сих пор мутационные паттерны регуляторного генома плохо изучены. Раскрытие механизмов, лежащих в основе регуляторных мутаций при раке, остается сложной задачей. Новые результаты этого исследования являются значительным и важным шагом на пути к пониманию причин и последствий мутаций, связанных с раком.
"Результаты этого исследования были совершенно неожиданными; они раскрывают второе лицо генома рака. Однако нам предстоит проделать большую работу, чтобы понять причины и последствия этих изменений", Профессор Аалтонен заявляет.
Результат совершенно неожиданный; контролируемые области, которые были обнаружены в исследовании, так же часто, как и объекты генетических мутаций, как и действительные известные гены рака. Открытие чрезвычайно важно, и работа раскрывает второе лицо генома рака у исследователей, однако – этого все еще достаточно для понимания причин и последствий изменений, – говорит Аалтонен