Исследователи из BGI, больницы Peking Union Medical College и др., сообщил об исследовании микробиома полости рта и кишечника при ревматоидном артрите (РА). Результаты показывают, что микробиом кишечника и полости рта вовлечены в патофизиологию и лечение РА и служат показанием для разработки персонализированных методов лечения с использованием микробиома. Последнее открытие было опубликовано сегодня в журнале Nature Medicine.
РА – изнурительное аутоиммунное заболевание, поражающее десятки миллионов людей во всем мире, в то время как смертность среди пациентов увеличивается из-за системных осложнений. Уже давно предполагается, что бактериальная инфекция связана с РА. Однако идентичность и функциональная способность ассоциированного с РА бактериального агента (ов) в значительной степени неясны. Модифицирующие заболевание противоревматические препараты (БПВП) облегчают, но не излечивают РА, и могут вызвать серьезные побочные эффекты. Исчерпывающее понимание микробиома, связанного с РА, открывает перспективы для новых достижений в патофизиологии РА, а также для ранней диагностики и точного лечения. В ходе исследования ученые выполнили метагеномное секвенирование с дробовиком и метагеномное исследование ассоциации (MGWAS) в образцах фекалий, зубов и слюны от пациентов с РА и здоровых людей из контрольной группы, а также наблюдали дисбактериальные изменения в кишечнике и микробиоме полости рта, частично восстановленные после лечения БПВП.
Исследования ассоциации метагенома (MGWAS) оказались мощным подходом к изучению микробиома кишечника при диабете 2 типа, колоректальном раке и т. Д. Это первое исследование микробиомов зубов и слюны. Исследователи обнаружили, что Haemophilus sp. истощается у пациентов с РА на всех трех участках кишечника и полости рта и отрицательно коррелирует с аутоантителами РА, в то время как Lactobacillus salivarius избыточно представлен у пациентов с РА во всех трех участках, особенно в очень активных случаях.
Также наблюдалась функциональная конвергенция – микробиомы кишечника и полости рта с RA демонстрируют аномалии в окислительно-восстановительной среде, транспорте и метаболизме железа, серы, цинка и аргинина, а также возможную молекулярную мимикрию связанных с RA человеческих антигенов.
Кроме того, исследование показывает, что микробные маркеры в кале, зубах и слюне могут быть полезны для диагностики и лечения РА, в то время как микробиом полости рта может быть более чувствительным к лечению БПВП, чем микробиом кишечника. Классификаторы на основе микробиома, которые позволяют отличать пациентов с РА от здоровых людей контрольной группы, были созданы для всех трех участков тела, а использование всех трех участков тела дополнительно повысило точность почти до 100%. Те же классификаторы применялись к образцам после лечения БПВП, а образцы зубов с низкой активностью заболевания часто классифицировались как здоровые, что соответствовало клиническому облегчению периодонтита у пациентов с РА после лечения.
Кроме того, были выявлены микробные маркеры кишечника и полости рта, которые, возможно, различают пациентов с различной продолжительностью заболевания, улучшением после DMARD и типами DMARD, хотя может потребоваться проверка в дополнительных когортах.
Сюань Чжан (Xuan Zhang), руководитель проекта и профессор больницы Пекинского унионного медицинского колледжа, сказал, что это исследование открывает путь к общему метагеномному ассоциативному исследованию микробиома полости рта и микробиома кишечника. Раскрывает доклиническую и клиническую фазы РА. Клиническая проверка еще больше углубит наше понимание РА. Мы ожидаем, что исследование ассоциации метагенома будет активно продвигать стратификацию пациентов, улучшение лекарств и новую терапевтическую мишень РА, а также приведет к точному диагнозу и лечению.